SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38

智人的SNP位点(dbSNP Build 151)

Bioconductor版本:3.14

NCBI dbSNP Build 151中智人的SNP位点和等位基因用于此包的源数据文件由NCBI于2018年2月16日至22日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p7 (GRCh38的补丁版本,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以被“注入”到BSgenome.Hsapiens.NCBI中。GRCh38或bsgenome . hspiens . ucsc .hg38。

作者:Hervé Pagès

维护人员:H. Pagès

引文(从R内,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews AnnotationData遗传学Homo_sapiensSNPlocs
版本 0.99.20
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.43.4)
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
链接
建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网