GenomicState

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicState

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenomicState。

构建和访问GenomicState对象源自Gencode derfinder工具使用

Bioconductor版本:3.14

这个包包含函数构建GenomicState对象Gencode等不同的注释来源。它还提供了在JHPCE访问这些文件。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GenomicState”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenomicState”)

HTML	R脚本	介绍GenomicState
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	AnnotationData,AnnotationHub,Homo_sapiens,TxDb
版本	0.99.15
许可证	艺术- 2.0
取决于	AnnotationHub
进口	GenomicFeatures,GenomeInfoDb,rtracklayer,bumphunter,derfinder(> = 1.21.7),AnnotationDbi,IRanges,org.Hs.eg.db、跑龙套、方法
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyle,sessioninfo,testthat(> =魅惑,胶水,derfinderPlot,AnnotationHubData,RefManageR,GenomicRanges,covr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/GenomicState
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/GenomicState
取决于我
进口我	brainflowprobes,recountWorkflow
建议我	dasper
我的链接

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GenomicState_0.99.15.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GenomicState/
包下载报告	下载数据