BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38。

智人全基因组序列(UCSC版本hg38，基于GRCh38.p13)

Bioconductor版本:3.14

由UCSC提供的智人(人类)的完整基因组序列(hg38，基于GRCh38.p13)并存储在Biostrings对象中。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	AnnotationData，BSgenome，遗传学，Homo_sapiens
版本	1.4.4
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)，BSgenome(> = 1.60.0)
进口	BSgenome
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked
进口我	分歧点，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.masked，musicatk，ORFhunteR，primirTSS，trena
建议我	BSgenome，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.major，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38.dbSNP151.minor，bsseq，BUSpaRse，ChIPpeakAnno，circRNAprofiler，cn，eisaR，enhancerHomologSearch，EpiTxDb，GenVisR，HiCDCPlus，MethReg，multicrispr，periodicDNA，pqsfinder，REMP，scanMiRApp，范围，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38，supersigs，TAPseq，Ularcirc，XNAString，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38_1.4.4.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38/
软件包下载报告	下载数据