这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AHLRBaseDbs。
Bioconductor版本:3.14
供应AnnotationHub与“LRbaseDb”中的注释数据库对许多物种。我们所有的SQLite文件生成Snakemake工作流(lrbase-workflow) (https://github.com/rikenbit/lrbase-workflow)。有关细节,请参见README。lrbase-workflow的md。
作者:露崎引人入胜(aut (cre) Manabu Ishii (aut) Itoshi Nikaido (aut)
维护人员:< k.t露崎引人入胜。答案在hotmail.co.jp >
从内部引用(R,回车引用(“AHLRBaseDbs”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AHLRBaseDbs”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“AHLRBaseDbs”)
HTML | R脚本 | 提供AnnotationHub LRBaseDb数据库 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | AnnotationData,AnnotationHub,FunctionalAnnotation,LRBaseDb |
版本 | 1.2.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | AnnotationHub(> = 2.22.0) |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/rikenbit/AHLRBaseDbs/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | AHLRBaseDbs_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/AHLRBaseDbs/ |
包下载报告 | 下载数据 |