# #——openraw - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(mzR)库(msdata) mzxml < -执行(“苏氨酸/ threonine_i2_e35_pH_tree。mzXML”,包= " msdata”) aa < - openMSfile (mzXML) # #——头信息- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - runInfo (aa) instrumentInfo (aa)头(aa, 1) # #——plotspectrum - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - pl < -峰值(aa, 10) peaksCount (aa, 10)头(pl)情节(pl [1], pl[2],类型=“h”, lwd = 1) # #——关闭文件- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -关闭(aa) # # openid - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -库(mzR)库(msdata)文件< -系统。文件(“mzid”、“Tandem.mzid。广州”,包= " msdata ") x < - openIDfile(文件)# #元数据- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - mzidInfo (x) # #——psms0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - p < - psm (x) colnames (p) # #——psms1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - m (x) < -修改头(m) # #——psms2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - scr <——分数(x) colnames (scr) # #——标签= sessioninfo,结果=“黑名单”,回声= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - toLatex (sessioninfo ())