tweeDEseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.tweeDEseq

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见tweeDEseq．

使用Poisson-Tweedie分布族的RNA-seq数据分析

Bioconductor版本:3.14

利用Poisson-Tweedie分布族对RNA-seq进行差异表达分析。

作者:Juan R Gonzalez 和Mikel Esnaola (由Robert Castelo贡献< Robert。Castelo在upf.edu>)

维护者:Juan R Gonzalez

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tweeDEseq”)

PDF	R脚本	tweeDEseq:使用Poisson-Tweedie分布族分析RNA-seq数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，StatisticalMethod
版本	1.40.0
在Bioconductor	BioC 2.9 (R-2.14)(10.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 2.12.0)
进口	质量，limma，刨边机平行,cqn
链接
建议	tweeDEseqCountData，xtable
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.creal.cat/jrgonzalez/software.htm
全靠我
进口我	ptmixed
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tweeDEseq_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	tweeDEseq_1.40.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	tweeDEseq_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tweeDEseq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tweeDEseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tweeDEseq/
软件包下载报告	下载数据