触发

DOI:10.18129 / B9.bioc.trigger

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅触发。

从遗传基因表达的转录监管推理

Bioconductor版本:3.14

这个R包提供的工具整合基因组数据的统计分析,涉及的一些组合:基因型,高维中间特征(如基因表达,蛋白质丰富),和高阶特征(表型)。包包含函数:(1)构建全球连锁遗传标记和基因表达之间的映射;(2)分析multiple-locus连杆(上位)基因表达;(3)全基因组变异的比例量化解释每个位点和识别eQTL热点;(4)估计双向因果概率基因调控以及构建基因调控网络;和(5)识别因果基因定量特征的兴趣。

作者:陈林s < lchen health.bsd.uchicago.edu >, Dipen p Sangurdekar < dps genomics.princeton.edu >和约翰·d·层< jstorey princeton.edu >

维修工:约翰·d·层< jstorey princeton.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“触发”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“触发”)

PDF	R脚本	触发教程
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,GeneticVariability,遗传学,微阵列,单核苷酸多态性,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.14.0),corpcor,qtl
进口	qvalue、方法、图形股东价值分析
链接
建议
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	trigger_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	trigger_1.40.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	trigger_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/trigger
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/触发
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/trigger/
包下载报告	下载数据