tidybulk

DOI:10.18129 / B9.bioc.tidybulk

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见tidybulk．

将转录组学引入潮流宇宙

Bioconductor版本:3.14

这是一个实用函数的集合，允许以模块化、管道友好和整洁的方式对RNA测序数据进行探索和计算。

作者:Stefano Mangiola [aut, cre]， Maria Doyle [ctb]

维护者:Stefano Mangiola

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tidybulk”)

超文本标记语言	R脚本	与底R的比较
超文本标记语言	R脚本	手稿代码-差异特征丰度
超文本标记语言	R脚本	手稿代码-转录签名识别
超文本标记语言	R脚本	小批量包装概述
PDF		参考手册

细节

biocViews	AssayDomain，聚类，DifferentialExpression，GeneExpression，基础设施，归一化，质量控制，RNASeq，测序，软件，转录，转录组
版本	1.6.1
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 4.1.0)
进口	宠物猫，readr，dplyr，magrittr，tidyr，stringi，stringr，rlang，purrr，tidyselect，preprocessCore，统计，并行，utils，生命周期，尺度，SummarizedExperiment，GenomicRanges、方法
链接
建议	BiocStyle，testthat，vctrs，AnnotationDbi，BiocManager，Rsubread，e1071，刨边机，limma，org.Hs.eg.db，org.Mm.eg.db，股东价值分析，GGally，knitr，qpdf，covr，修拉，KernSmooth，Rtsne，S4Vectors，ggplot2，widyr，clusterProfiler，msigdbr，DESeq2，扫帚，生存，引导，betareg，tidyHeatmap，pasilla，ggrepel，devtools，功能，survminer，tidySummarizedExperiment，减价，uwot
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/stemangiola/tidybulk
BugReports	https://github.com/stemangiola/tidybulk/issues
全靠我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	tidybulk_1.6.1.tar.gz
Windows二进制	tidybulk_1.6.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	tidybulk_1.6.1.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tidybulk
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tidybulk
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/tidybulk/
软件包下载报告	下载数据