subSeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.subSeq

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅subSeq。

二次抽样的高通量测序数据

Bioconductor版本:3.14

二次抽样的高通量测序数据用于实验设计和分析。

作者:大卫罗宾逊,约翰·d·层的贡献安德鲁j .鲈鱼

维修工:安德鲁·j·巴斯< ajbass princeton.edu >,约翰·d·层< jstorey princeton.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“subSeq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“subSeq”)

PDF	R脚本	subSeq例子
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,转录
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.2)
进口	data.table,dplyr,tidyr,ggplot2,magrittr,qvalue(> = 1.99),消化,Biobase
链接
建议	limma,刨边机,DESeq2,DEXSeq(> = 1.9.7),testthat,knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://github.com/StoreyLab/subSeq
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	subSeq_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	subSeq_1.24.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	subSeq_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/subSeq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ subSeq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/subSeq/
包下载报告	下载数据