此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见specL.
Bioconductor版本:3.14
提供了一个生成光谱库的函数,可用于蛋白质组学中的MRM SRM MS工作流程。该软件包提供了一个BiblioSpec阅读器,一个可以使用FASTA格式的氨基酸文件添加蛋白质信息的函数,以及一个用于在Spectronaut软件中使用创建的库的导出方法。该软件包在苏黎世功能基因组学中心开发、测试和使用
作者:Christian Panse [aut, cre],乔纳斯·格罗斯曼[au],特拉克塞尔[aut],沃斯基[ctb]
维护者:Christian Panse
引文(从R内,输入引用(“specL”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“specL”)
超文本标记语言 | R脚本 | 自动工作流程 |
R脚本 | specL简介 | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | MassSpectrometry,蛋白质组学,软件 |
版本 | 1.28.0 |
在Bioconductor | BioC 3.0 (R-3.1)(7.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.6),DBI(>= 0.5),方法(>= 3.3)protViz(> = 0.5),RSQLite(> = 1.1),seqinr(> = 3.3) |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocGenerics,BiocStyle(> = 2.2),knitr(> = 1.15),rmarkdown,RUnit(> = 0.4) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/specL/ |
BugReports | https://github.com/fgcz/specL/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | msqc1,NestLink |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | specL_1.28.0.tar.gz |
Windows二进制 | specL_1.28.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | specL_1.28.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/specL |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/specL |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/specL/ |
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