spatialHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.spatialHeatmap

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见spatialHeatmap．

spatialHeatmap

Bioconductor版本:3.14

spatialHeatmap包根据数字色键对解剖图像中定义的相应空间特征进行着色，从而提供了可视化生物分析的细胞、组织和器官特定数据的功能。

作者:张建海[aut, trl, cre]， Jordan Hayes [aut]，张乐[aut]，杨兵[aut]， Wolf Frommer [aut]， Julia Bailey-Serres [aut]， Thomas Girke [aut]

维护者:张建海<建海。张在email.ucr.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“spatialHeatmap”)

超文本标记语言	R脚本	spatialHeatmap:可视化解剖图像和网络图中的空间分析
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ATACSeq，CellBasedAssays，CellBiology，聚类，DNASeq，DataRepresentation，GeneExpression，GeneTarget，GraphAndNetwork，微阵列，网络，测序，SingleCell，软件，TissueMicroarray，可视化
版本	2.0.0
在Bioconductor	BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.5.0)
进口	av，BiocFileCache，data.table，DESeq2，截然不同的，刨边机，WGCNA，flashClust，htmlwidgets，genefilter，ggplot2，ggdendro，grImport、网格gridExtra，gplots，igraph，HDF5Array，limma、方法、魔法，rsvg，闪亮的，dynamicTreeCut， grDevices，图形，ggplotify平行,情节，的方式，rappdirs，reshape2统计数据,SummarizedExperiment，shinydashboard，S4Vectors跑龙套,visNetwork，UpSetR，xml2，yaml
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，BiocSingular，RUnit，BiocGenerics，ExpressionAtlas，DT，Biobase，GEOquery，shinyWidgets，shinyjs，htmltools，shinyBS，可分类的，嘘，食物
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap
BugReports	https://github.com/jianhaizhang/spatialHeatmap/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	spatialHeatmap_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	spatialHeatmap_2.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	spatialHeatmap_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialHeatmap
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/spatialHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spatialHeatmap/
软件包下载报告	下载数据