sparseMatrixStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.sparseMatrixStats

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sparseMatrixStats。

汇总统计数据稀疏矩阵的行和列

Bioconductor版本:3.14

高性能功能对稀疏矩阵行和列的操作。例如:/ rowMeans2上校,上校/ rowMedians坳/ rowvar等。目前,优化仅限于列中的数据稀疏格式。这个包是受Henrik Bengtsson matrixStats包。

作者:江诗丹顿Ahlmann-Eltze (aut (cre)

维护人员:江诗丹顿Ahlmann-Eltze < artjom31415 googlemail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sparseMatrixStats”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sparseMatrixStats”)

HTML	R脚本	sparseMatrixStats
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	MatrixGenerics(> = 1.5.3)更正
进口	Rcpp,矩阵,matrixStats(> = 0.60.0)方法
链接	Rcpp
建议	testthat(> =魅惑,knitr,板凳上,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats
BugReports	https://github.com/const-ae/sparseMatrixStats/issues
取决于我
进口我	atena,DelayedMatrixStats,GSVA
建议我	MatrixGenerics,scPCA
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sparseMatrixStats_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	sparseMatrixStats_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	sparseMatrixStats_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sparseMatrixStats
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sparseMatrixStats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sparseMatrixStats/
包下载报告	下载数据