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siggenes
DOI:10.18129 / B9.bioc.siggenes
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅siggenes。
多个测试使用萨姆和埃夫隆的经验贝叶斯方法
Bioconductor版本:3.14
识别差异表达基因和估计的错误发现率(罗斯福)使用微阵列(SAM)的意义分析和经验贝叶斯分析微阵列(EBAM)。
作者:Holger Schwender
维护人员:Holger Schwender < Holger。等在gmx.de >
从内部引用(R,回车引用(“siggenes”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“siggenes”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“siggenes”)
| HTML | identify.sam.html | |
| HTML | plot.ebam.html | |
| HTML | plot.finda0.html | |
| HTML | plot.sam.html | |
| HTML | print.ebam.html | |
| HTML | print.finda0.html | |
| HTML | print.sam.html | |
| R脚本 | siggenes手册 | |
| siggenesRnews.pdf | ||
| HTML | summary.ebam.html | |
| HTML | summary.sam.html | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,ExonArray,GeneExpression,微阵列,MultipleComparison,单核苷酸多态性,软件 |
| 版本 | 1.68.0 |
| Bioconductor自 | BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17年) |
| 许可证 | LGPL (> = 2) |
| 取决于 | Biobase,乘、样条函数、方法 |
| 进口 | stats4 grDevices,图形,统计数据,scrime(> = 1.2.5) |
| 链接 | |
| 建议 | affy,注释,genefilter,KernSmooth |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | KCsmart |
| 进口我 | coexnet,DAPAR,DeSousa2013,minfi,三人组,XDE |
| 建议我 | GCSscore,logicFS |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | siggenes_1.68.0.tar.gz |
| Windows二进制 | siggenes_1.68.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | siggenes_1.68.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/siggenes |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ siggenes |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/siggenes/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
