sigPathway

DOI:10.18129 / B9.bioc.sigPathway

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅sigPathway。

路径分析

Bioconductor版本:3.14

进行路径分析,计算中描述的NT_k和NE_k统计田et al . (2005)

作者:Weil赖(R和C代码优化),陆田和彼得公园(R算法开发和初始代码)

维修工:Weil赖< wlai alum.mit.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“sigPathway”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“sigPathway”)

PDF	R脚本	sigPathway
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,MultipleComparison,软件
版本	1.62.0
Bioconductor自	BioC 1.9 (r - 2.4)(15.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 2.10)
进口
链接
建议	hgu133a.db(> = 1.10.0),XML(1.6 > = 3),AnnotationDbi(> = 1.3.12)
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.pnas.org/cgi/doi/10.1073/pnas.0506577102http://www.chip.org/ ppark /补充/ PNAS05.html
取决于我	tRanslatome
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	sigPathway_1.62.0.tar.gz
Windows二进制	sigPathway_1.62.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	sigPathway_1.62.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigPathway
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sigPathway
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/sigPathway/
包下载报告	下载数据