天窗

DOI:10.18129 / B9.bioc.scuttle

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见天窗

单细胞rna序列分析实用程序

Bioconductor版本:3.14

提供用于执行单单元分析的基本实用函数,重点关注简单的规范化、质量控制和数据转换。还提供了一些帮助器函数来帮助开发其他包。

作者:Aaron Lun [aut, cre], Davis McCarthy [aut]

维护者:Aaron Lun 的键盘

引文(从R内,输入引用(“天窗”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“天窗”)

超文本标记语言 R脚本 1.质量控制
超文本标记语言 R脚本 2.归一化
超文本标记语言 R脚本 3.其他功能
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImportGeneExpressionImmunoOncology归一化预处理质量控制RNASeq测序SingleCell软件转录组
版本 1.4.0
在Bioconductor BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年)
许可证 GPL-3
取决于 SingleCellExperiment
进口 方法,utils,统计,矩阵RcppBiocGenericsS4VectorsBiocParallelGenomicRangesSummarizedExperimentDelayedArrayDelayedMatrixStatsbeachmat
链接 Rcppbeachmat
建议 BiocStyleknitrscRNAseqrmarkdowntestthat食物
SystemRequirements c++ 11
增强了
URL
全靠我 食物
进口我 基础知识后面;DropletUtils火焰imcRtools米娅mumosa马斯喀特scDblFinder伶盗龙
建议我 咆哮HCADataMouseThymusAgeing一口飞溅TSCAN
链接到我 DropletUtils食物
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 scuttle_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 scuttle_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) scuttle_1.4.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scuttle
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ scutle
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scuttle/
软件包下载报告 下载数据

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网