此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见天窗.
Bioconductor版本:3.14
提供用于执行单单元分析的基本实用函数,重点关注简单的规范化、质量控制和数据转换。还提供了一些帮助器函数来帮助开发其他包。
作者:Aaron Lun [aut, cre], Davis McCarthy [aut]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“天窗”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“天窗”)
超文本标记语言 | R脚本 | 1.质量控制 |
超文本标记语言 | R脚本 | 2.归一化 |
超文本标记语言 | R脚本 | 3.其他功能 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,GeneExpression,ImmunoOncology,归一化,预处理,质量控制,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组 |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | SingleCellExperiment |
进口 | 方法,utils,统计,矩阵,Rcpp,BiocGenerics,S4Vectors,BiocParallel,GenomicRanges,SummarizedExperiment,DelayedArray,DelayedMatrixStats,beachmat |
链接 | Rcpp,beachmat |
建议 | BiocStyle,knitr,scRNAseq,rmarkdown,testthat,食物 |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | 嘘,食物 |
进口我 | 基础知识,后面;,DropletUtils,火焰,imcRtools,米娅,mumosa,马斯喀特,scDblFinder,伶盗龙 |
建议我 | 咆哮,HCAData,MouseThymusAgeing,单,一口,飞溅,TSCAN |
链接到我 | DropletUtils,食物 |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | scuttle_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | scuttle_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | scuttle_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scuttle |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ scutle |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scuttle/ |
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