scp

DOI:10.18129 / B9.bioc.scp

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scp

质量Spectrometry-Based单细胞蛋白质组学数据分析

Bioconductor版本:3.14

效用函数用于操作、处理和分析质量spectrometry-based单细胞蛋白质组学(SCP)的数据。这个包是一个扩展QFeatures包为SCP应用程序而设计的。

作者:克利斯朵夫Vanderaa (aut (cre)。劳伦与(aut)

维护人员:克利斯朵夫Vanderaa <克利斯朵夫。在uclouvain.be vanderaa >

从内部引用(R,回车引用(“scp”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scp”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scp”)

HTML R脚本 先进的使用“scp”
HTML R脚本 使用readSCP加载数据
HTML R脚本 QFeatures简而言之
HTML R脚本 单个细胞蛋白质组学数据处理和分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssays,GeneExpression,MassSpectrometry,预处理,蛋白质组学,SingleCell,软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 4.0),QFeatures(> = 1.3.5)
进口 方法、统计跑龙套,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,MultiAssayExperiment,MsCoreUtils,matrixStats,S4Vectors,dplyr,magrittr,rlang
链接
建议 testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,拼接而成,ggplot2,嫁祸于,,股东价值分析,preprocessCore,vsn,uwot
SystemRequirements
增强了
URL https://UCLouvain-CBIO.github.io/scp
BugReports https://github.com/UCLouvain-CBIO/scp/issues
取决于我
进口我
建议我 scpdata
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 scp_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 scp_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉) scp_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scp
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scp
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scp/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网