scoreInvHap

DOI:10.18129 / B9.bioc.scoreInvHap

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scoreInvHap

在预定义的地区得到反演状态

Bioconductor版本:3.14

scoreInvHap可以得到样品的反转状态已知的反演。scoreInvHap使用SNP数据作为输入,需要以下信息反演:基因型频率在不同的单体型,R2地区SNPs和反转状态和杂合子基因型之间的参考。包包括21这个数据反演。

作者:卡洛斯·鲁伊斯(aut),悲哀Pelegri (aut),胡安·r·冈萨雷斯(aut (cre)

维护人员:悲哀Pelegri-Siso <悲哀。在isglobal.org pelegri >

从内部引用(R,回车引用(“scoreInvHap”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scoreInvHap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scoreInvHap”)

HTML R脚本 基因分型结果反演与scoreInvHap
PDF 参考手册
文本 许可证

细节

biocViews 遗传学,GenomicVariation,单核苷酸多态性,软件
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R (> = 3.6.0)
进口 Biostrings、方法、snpStats,VariantAnnotation,GenomicRanges,BiocParallel、图形、SummarizedExperiment
链接
建议 testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 scoreInvHap_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 scoreInvHap_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉) scoreInvHap_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scoreInvHap
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scoreInvHap
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scoreInvHap/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网