这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scTensor。
Bioconductor版本:3.14
该算法是基于nnTensor的非负分解塔克(NTD2)。
作者:露崎引人入胜(aut (cre) Kozo Nishida (aut)
维护人员:< k.t露崎引人入胜。答案在hotmail.co.jp >
从内部引用(R,回车引用(“scTensor”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scTensor”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scTensor”)
HTML | R脚本 | scTensor |
HTML | R脚本 | scTensor: 1。数据格式转换和ID |
HTML | R脚本 | scTensor: 2。HTML报告的解释 |
HTML | R脚本 | scTensor: 3。模拟CCI |
HTML | R脚本 | scTensor: 4。再分析scTensor的结果 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DimensionReduction,GeneExpression,SingleCell,软件 |
版本 | 2.4.1 |
Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1.0) |
进口 | 方法,RSQLite,igraph,S4Vectors,情节,reactome.db,AnnotationDbi,SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,nnTensor(> = 1.1.5),ccTensor(> = 1.0.2中),rTensor(> = 1.4.8),abind,plotrix,的热图,tagcloud,rmarkdown,BiocStyle,knitr,AnnotationHub,MeSHDbi(> = 1.29.2)grDevices、图形数据,跑龙套,离群值,类别,meshr(> = 1.99.1),GOstats,ReactomePA,剂量,蜡笔,使彻底失败,BiocManager,visNetwork,schex,ggplot2 |
链接 | |
建议 | testthat,LRBaseDbi,修拉,scTGIF,Homo.sapiens |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scTensor_2.4.1.tar.gz |
Windows二进制 | scTensor_2.4.1.zip |
macOS 10.13(高山脉) | scTensor_2.4.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTensor |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scTensor |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scTensor/ |
包下载报告 | 下载数据 |