scTGIF

DOI:10.18129 / B9.bioc.scTGIF

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scTGIF。

细胞类型为未经单细胞RNA-Seq数据注释

Bioconductor版本:3.14

scTGIF连接相关的细胞和基因功能的细胞类型标签。

作者:露崎引人入胜(aut (cre)

维护人员:< k.t露崎引人入胜。答案在hotmail.co.jp >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scTGIF”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scTGIF”)

HTML	R脚本	scTGIF
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,GeneExpression,质量控制,SingleCell,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	GSEABase,Biobase,SingleCellExperiment,BiocStyle,情节,tagcloud,rmarkdown,RcppgrDevices,图形,跑龙套,knitr,S4Vectors,SummarizedExperiment,RColorBrewer,nnTensor、方法、尺度,msigdbr,schex,宠物猫,ggplot2,igraph
链接
建议	testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我	scTensor
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scTGIF_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	scTGIF_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	scTGIF_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTGIF
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scTGIF
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scTGIF/
包下载报告	下载数据