scRecover

DOI:10.18129 / B9.bioc.scRecover

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scRecover。

scRecover归责的单细胞RNA-seq数据

Bioconductor版本:3.14

scRecover是归责的R包的单细胞RNA-seq (scRNA-seq)数据。它将检测和转嫁辍学值scRNA-seq原始读计数矩阵同时保持真正的零不变,因为都是辍学0和真正的零scRNA-seq数据。通过结合scImpute,储蓄者和魔法,scRecover不仅检测辍学和真正的零更高的精度,而且提高下游集群和可视化的结果。

作者:逸苗,Xuegong张< zhangxg tsinghua.edu.cn >

维护人员:逸苗族< miaoz13 tsinghua.org.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scRecover”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“scRecover”)

HTML	R脚本	scRecover
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,预处理,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	统计数据、跑龙套、方法、图形doParallel,foreach平行,处罚,kernlab,rsvd,矩阵-14年(> = 1.2),质量-45年(> = 7.3),pscl(> = 1.4.9),bbmle(> = 1.0.18),gamlss(4.4 > = 0),preseqR(> = 4.0.0),储蓄者(> = 1.1.1),Rmagic(1.3.0 > =版本),BiocParallel(> = 1.12.0)
链接
建议	knitr,rmarkdown,SingleCellExperiment,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://miaozhun.github.io/scRecover
BugReports	https://github.com/miaozhun/scRecover/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	scRecover_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	scRecover_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	scRecover_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scRecover
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scRecover
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/scRecover/
包下载报告	下载数据