散粒

DOI:10.18129 / B9.bioc.scHOT

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅散粒

单细胞高阶测试

Bioconductor版本:3.14

单细胞高阶测试(散粒)是一个R包,促进测试的高阶结构基因表达的变化以及发展轨迹或跨空间。散粒一般和模块化,可以运行在多个数据的上下文,如连续轨迹,离散群体之间,和在空间取向;以及适应任何高阶测量如可变性或相关性。散粒显著增加了一阶效应测试,如微分表达式,提供了一个框架,用于询问高阶从单细胞数据交互。

作者:Shila Ghazanfar (aut (cre) Yingxin林(aut)

维护人员:Shila Ghazanfar < shazanfar gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(散粒)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(散粒)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(散粒)

HTML R脚本 开始:散粒
PDF 参考手册

细节

biocViews GeneExpression,RNASeq,测序,SingleCell,软件,转录组
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.0)
进口 S4Vectors(> = 0.24.3),SingleCellExperiment,矩阵,SummarizedExperiment,IRanges、方法、统计数据BiocParallel,重塑,ggplot2,igraphgrDevices,ggforce、图形
链接
建议 knitr,减价,rmarkdown,,scattermore,尺度,matrixStats,deldir
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 scHOT_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 scHOT_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉) scHOT_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scHOT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/散粒
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scHOT/
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