这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scFeatureFilter。
Bioconductor版本:3.14
R实施correlation-based Joshi实验室开发的方法来分析和过滤处理单细胞RNAseq数据。它返回一个过滤版本的数据只包含基因表达值受到系统噪声的影响。
作者:洛杉矶Arzalluz-Luque (aut) Guillaume Devailly (aut (cre) Anagha Joshi (aut)
维护人员:Guillaume Devailly < gdevailly hotmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“scFeatureFilter”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scFeatureFilter”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“scFeatureFilter”)
HTML | R脚本 | 介绍scFeatureFilter |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | GeneExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,SingleCell,软件 |
版本 | 1.14.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(4年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 3.6) |
进口 | dplyr(> = 0.7.3),ggplot2(> =魅惑,magrittr(> = 1.5),rlang(> = 0.1.2),宠物猫(> = 1.3.4)、统计方法 |
链接 | |
建议 | testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,scRNAseq,cowplot |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | scFeatureFilter_1.14.0.tar.gz |
Windows二进制 | scFeatureFilter_1.14.0.zip |
macOS 10.13(高山脉) | scFeatureFilter_1.14.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scFeatureFilter |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scFeatureFilter |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/scFeatureFilter/ |
包下载报告 | 下载数据 |