scClassify

DOI:10.18129 / B9.bioc.scClassify

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅scClassify

scClassify:单细胞分层分类

Bioconductor版本:3.14

scClassify是单细胞RNA-seq数据的多尺度分类框架基于整体学习和细胞类型层次结构,使所需样本量估计准确的细胞类型分类和联合细胞分类使用多个引用。

作者:Yingxin林

维护人员:林Yingxin < Yingxin。林在sydney.edu.au >

从内部引用(R,回车引用(“scClassify”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“scClassify”)

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文档

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HTML R脚本 scClassify
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文本 新闻

细节

biocViews 分类,GeneExpression,SingleCell,软件
版本 1.6.0
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 4.0)
进口 S4Vectors,limma,ggraph,igraph、方法、集群,minpack.lm,mixtools,BiocParallel,代理,proxyC,矩阵,ggplot2,hopach,diptest,mgcv、统计数据、图表、statmod,Cepo
链接
建议 knitr,rmarkdown,BiocStyle,pkgdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/SydneyBioX/scClassify/issues
取决于我
进口我
建议我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 scClassify_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 scClassify_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉) scClassify_1.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scClassify
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ scClassify
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/scClassify/
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