rqt

DOI:10.18129 / B9.bioc.rqt

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rqt。

rqt:公用事业能够荟萃分析

Bioconductor版本:3.14

尽管现代GWAS方法的最新进展,它仍然是一个重要的问题,解决计算整个基因的效应值和相应的假定值而不是单一的变体。R -包rqt提供能够GWAS荟萃分析。有关更多信息,请参见:“基因簇协会新一代测序数据的测试”李et al(2016),生物信息学,32 (17),i611-i619, 。

作者:i . y . Zhbannikov, k . g . Arbeev人工智能Yashin。

维护人员:Ilya y Zhbannikov < Ilya。在duke.edu zhbannikov >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rqt”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rqt”)

HTML	R脚本	教程为rqt包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GenomeWideAssociation,PrincipalComponent,回归,测序,软件,StatisticalMethod,生存
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5年)
许可证	GPL
取决于	R (> = 3.4),SummarizedExperiment
进口	统计数据,矩阵,ropls、方法、车,RUnit,metap,CompQuadForm,glmnet跑龙套,请
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/izhbannikov/rqt
BugReports	https://github.com/izhbannikov/rqt/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rqt_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	rqt_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	rqt_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rqt
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rqt
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rqt/
包下载报告	下载数据