rfPred

DOI:10.18129 / B9.bioc.rfPred

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rfPred。

rfPred功能预测分数分配给一个错义变量列表

Bioconductor版本:3.14

基于外部大量数据文件rfPred分数在所有人类基因组位置的外显子组预计算,包给错义rfPred分数变异识别染色体的位置(hg19版),参照和替代nucleotids和uniprot标识符的蛋白质。注意,使用的包,用户必须连接在互联网上或下载TabixFile和索引(大约3.3去)。

作者:也是Jabot-Hanin,雨果Varet和让-菲利普•洁

维护人员:雨果Varet < varethugo gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rfPred”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rfPred”)

PDF	R脚本	CalculatingrfPredscoreswithpackagerfPred
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,分类,软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	Rsamtools,GenomicRanges,IRanges,data.table、方法、并行
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.sbim.fr/rfPred
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	rfPred_1.32.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	rfPred_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rfPred
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rfPred
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rfPred/
包下载报告	下载数据