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regsplice
DOI:10.18129 / B9.bioc.regsplice
此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见regsplice．
基于l1正则化的差分拼接检测方法
Bioconductor版本:3.14
在RNA-seq和外显子微阵列数据中检测差异剪接(差异外显子使用)的统计方法，使用l1正则化(套索)来提高功率。
作者:卢卡斯·m·韦伯[aut, cre]
维护人员:Lukas M. Weber < lukas.web.edu at gmail.com>
引文(从R内，输入引用(“regsplice”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“regsplice”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | regsplice工作流 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | AlternativeSplicing，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，ExonArray，ExperimentalDesign，ImmunoOncology，微阵列，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 1.20.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年) |
| 许可证 | MIT +文件许可证 |
| 取决于 | |
| 进口 | glmnet，SummarizedExperiment，S4Vectors，limma，刨边机统计数据,pbapply， utils，方法 |
| 链接 | |
| 建议 | testthat，BiocStyle，knitr，rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/lmweber/regsplice |
| BugReports | https://github.com/lmweber/regsplice/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | regsplice_1.20.0.tar.gz |
| Windows二进制 | regsplice_1.20.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | regsplice_1.20.0.tgz |
| 源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/regsplice |
| 源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/regsplice |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/regsplice/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
