rBiopaxParser

DOI:10.18129 / B9.bioc.rBiopaxParser

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅rBiopaxParser

解析BioPax文件和在R代表他们

Bioconductor版本:3.14

解析BioPAX文件和代表在R,此刻BioPAX 2级和3级支持。

作者:弗兰克·克莱默

维护人员:弗兰克·克雷默< frank.kramer在informatik.uni-augsburg.de >

从内部引用(R,回车引用(“rBiopaxParser”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“rBiopaxParser”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“rBiopaxParser”)

PDF R脚本 rBiopaxParser装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation,软件
版本 2.34.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(9年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R (> = 4.0),data.table
进口 XML
链接
建议 Rgraphviz,RCurl,,RUnit,BiocGenerics,RBGL,igraph
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/frankkramer-lab/rBiopaxParser
取决于我
进口我 pwOmics
建议我 AnnotationHub,NetPathMiner
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 rBiopaxParser_2.34.0.tar.gz
Windows二进制 rBiopaxParser_2.34.0.zip
macOS 10.13(高山脉) rBiopaxParser_2.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBiopaxParser
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ rBiopaxParser
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/rBiopaxParser/
包下载报告 下载数据

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Bioconductor

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网