projectR

DOI:10.18129 / B9.bioc.projectR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅projectR。

从主成分分析权重函数的投影,CoGAPS, NMF、相关性和集群

Bioconductor版本:3.14

函数的投影数据空间利用主成分分析法(PCA)定义,CoGAPS, NMF、相关性和集群。

作者:Gaurav沙玛,吉纳维芙Stein-O ' brien

维护人员:吉纳维芙Stein-O ' brien < gsteinobrien gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“projectR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“projectR”)

PDF	R脚本	projectR
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	BiologicalQuestion,FunctionalPrediction,GeneRegulation,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL (= = 2)
取决于
进口	方法,集群统计数据,limma,CoGAPS,NMF,ROCR,ggalluvial,RColorBrewer,dplyr,reshape2,冬青,尺度,ggplot2
链接
建议	BiocStyle,gridExtra、网格testthat,devtools,knitr,rmarkdown,ComplexHeatmap
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/genesofeve/projectR/
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/projectR/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	projectR_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	projectR_1.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	projectR_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/projectR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ projectR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/projectR/
包下载报告	下载数据