proBAMr

DOI:10.18129 / B9.bioc.proBAMr

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅proBAMr。

生成山姆文件psm的猎枪蛋白质组学数据

Bioconductor版本:3.14

映射psm回基因组。包构建山姆从猎枪蛋白质组学数据文件包还提供了函数注释从GTF文件做准备。

作者:小菁王

维护人员:小菁王<小菁。王在vanderbilt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“proBAMr”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“proBAMr”)

PDF	R脚本	介绍proBAMr
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.0.1),IRanges,AnnotationDbi
进口	GenomicRanges,Biostrings,GenomicFeatures,rtracklayer
链接
建议	RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	proBAMr_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	proBAMr_1.28.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	proBAMr_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/proBAMr
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ proBAMr
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/proBAMr/
包下载报告	下载数据