predictionet

DOI:10.18129 / B9.bioc.predictionet

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.14版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅predictionet。

推理预测网络设计(但不限于)基因组数据

Bioconductor版本:3.14

这个包包含一组相关功能网络推理结合基因组数据和之前信息提取生物医学文献和结构化生物数据库。主要功能是能够生成网络使用贝叶斯或回归推理方法;前者仅限于< 100的变量,后者可能推断网络与数以百计的变量。几个统计边缘和节点级别已经实现(边缘稳定性,预测能力的每个节点,…),以帮助用户关注高质量的子网。最终,这个包是用于预测网络的web应用程序开发的协作与Entagen dana - farber癌症研究所。

作者:本杰明·Haibe-Kains Catharina奥尔森,蒋禄卡波特米,约翰Quackenbush

维护人员:本杰明Haibe-Kains < bhaibeka jimmy.harvard.edu >, Catharina奥尔森< colsen在ulb.ac.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“predictionet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“predictionet”)

PDF	R脚本	predictionet
PDF		参考手册
文本		自述

细节

biocViews	GraphAndNetwork,NetworkInference,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	igraph,catnet
进口	处罚,RBGL,质量
链接
建议	网络,minet,knitr
SystemRequirements
增强了
URL	http://compbio.dfci.harvard.eduhttp://www.ulb.ac.be/di/mlg
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	predictionet_1.40.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	predictionet_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/predictionet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ predictionet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/predictionet/
包下载报告	下载数据