plotGrouper

DOI:10.18129 / B9.bioc.plotGrouper

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅plotGrouper。

闪亮的应用程序GUI包装ggplot内置统计分析

Bioconductor版本:3.14

闪亮的app-based为ggplot GUI包装器内置统计分析。导入的数据文件并使用下拉菜单和复选框指定绘制变量,图表类型,看看你的阴谋。一旦创建,情节可以保存独立或存储在一份报告中,可以保存为pdf。如果新数据添加到文件,报告可以更新包括新的数据。统计测试可以选择并添加到图表中。流式细胞术分析数据尤其与plotGrouper集成。统计数据可以转化为返回细胞样本的绝对数量(此功能需要包容的珠子每样的数量和信息进行的任何稀释)。

作者:约翰。d . Gagnon (aut (cre)

维护人员:约翰。d . Gagnon < john.gagnon。42在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“plotGrouper”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“plotGrouper”)

HTML	R脚本	plotGrouper
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,FlowCytometry,GUI,GraphAndNetwork,ImmunoOncology,MultipleComparison,软件,StatisticalMethod
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.5)
进口	ggplot2(> = 3.0.0),dplyr(> = 0.7.6),tidyr(> = 0.2.0),宠物猫(> = 1.4.2),stringr(> = 1.3.1),readr(> = 1.1.1),readxl(> = 1.1.0),尺度(> = 1.0.0)、统计数据、网格gridExtra(> = 2.3),蛋(> = 0.4.0),gtable(> = 0.2.0),ggpubr(> = 0.1.8),闪亮的(> = 1.1.0),shinythemes(> = 1.1.1),colourpicker(> = 1.0),magrittr(> = 1.5),Hmisc(> =以下4.4.1),rlang(> = 0.2.2)
链接
建议	knitr,htmltools,BiocStyle,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://jdgagnon.github.io/plotGrouper/
BugReports	https://github.com/jdgagnon/plotGrouper/issues
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	plotGrouper_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	plotGrouper_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	plotGrouper_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/plotGrouper
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ plotGrouper
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/plotGrouper/
包下载报告	下载数据