此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见panelcn.mops.
Bioconductor版本:3.14
CNV检测工具针对NGS面板数据。cn扩展名。拖把包。
作者:Verena Haunschmid [aut], Gundula Povysil [aut, cre]
维护者:Gundula Povysil < Povysil at bioinf.jku.at>
引文(从R内,输入引用(“panelcn.mops”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("panelcn.mops")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“panelcn.mops”)
R脚本 | panelcn.mops: Manual for the R package | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | CellBiology,CopyNumberVariation,遗传学,GenomicVariation,测序,软件,VariantDetection |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年) |
许可证 | LGPL (>= 2.0) |
取决于 | R (>= 3.4),cn.mops,方法,utils,统计,图形 |
进口 | GenomicRanges,Rsamtools,IRanges,S4Vectors,GenomeInfoDb, grDevices |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,RUnit,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | CopyNumberPlots |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | panelcn.mops_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | panelcn.mops_1.16.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | panelcn.mops_1.16.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/panelcn.mops |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/panelcn.mops |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/panelcn.mops/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |