ontoProc

DOI:10.18129 / B9.bioc.ontoProc

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见ontoProc

解剖、细胞系等本体的处理

Bioconductor版本:3.14

支持收集各种生物信息本体,特别利用CRAN上的ontologyIndex包。我们提供了关于细胞、细胞系、化合物和解剖学术语的关键本体快照,以帮助分析基因组规模的实验,特别是细胞x化合物筛选。另一个目的是加强引人注目的用例的开发,以实现新兴本体的更丰富的接口。

作者:Vince Carey

维护者:VJ Carey

引文(从R内,输入引用(“ontoProc”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ontoProc”)

超文本标记语言 R脚本 ontoProc:一些面向本体的实用程序,为Bioconductor提供单细胞功能
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施软件
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.6 (R-3.4)(4.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.5),ontologyIndex
进口 BiobaseS4Vectors、方法、AnnotationDbi,统计,utils,BiocFileCache闪亮的RgraphvizontologyPlotdplyrmagrittrDTigraphAnnotationHub
链接
建议 knitrorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbtestthatBiocStyleSingleCellExperimentcelldexrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我 pogotenXplore
建议我 BiocOncoTK
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ontoProc_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 ontoProc_1.16.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ontoProc_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ontoProc
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ontoProc
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ontoProc/
软件包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请细阅发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下位置之一:

  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网