nempi

DOI:10.18129 / B9.bioc.nempi

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅nempi。

从基因表达数据推断未被注意的扰动

Bioconductor版本:3.14

使用一个不完整的微扰概要文件作为输入,并在日志赔率和推断基因差异表达的扰动和增加观察的。推理是由迭代地推断一个网络的扰动和推断网络的扰动。网络推理是由嵌套的影响模型。

作者:马丁Pirkl (aut (cre)

维护人员:马丁Pirkl < martinpirkl在yahoo.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“nempi”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“nempi”)

HTML	R脚本	nempi
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ATACSeq,CRISPR,分类,DNASeq,DifferentialExpression,DifferentialMethylation,GeneExpression,GeneSignaling,网络,NetworkInference,NeuralNetwork,通路,PooledScreens,RNASeq,SingleCell,软件,SystemsBiology
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1),mnem
进口	e1071,nnet,randomForest,naturalsort、图表、数据、跑龙套,matrixStats,epiNEM
链接
建议	knitr,BiocGenerics,rmarkdown,RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/cbg-ethz/nempi/
BugReports	https://github.com/cbg-ethz/nempi/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	nempi_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	nempi_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	nempi_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nempi
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ nempi
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nempi/
包下载报告	下载数据