mzID

DOI:10.18129 / B9.bioc.mzID

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅mzID。

一个R mzIdentML解析器

Bioconductor版本:3.14

解析器mzIdentML文件使用XML实现方案。解析器试图成为将军,能够处理所有类型的mzIdentML文件的缺点有“漂亮”输出低于供应商特定的解析器。请联系任何问题的维护者和供给一个mzIdentML文件可以快速固定的问题。

作者:洛朗与(施,cre)托马斯·皮德森(aut),弗拉季斯拉夫•Petyuk(施)

维修工:Laurent与<劳伦。与在uclouvain.be >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“mzID”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“mzID”)

PDF	R脚本	使用mzID
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,ImmunoOncology,MassSpectrometry,蛋白质组学,软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法
进口	XML,plyr平行,doParallel,foreach,迭代器,ProtGenerics
链接
建议	knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	蛋白质组学
进口我	MSGFgui,MSGFplus,MSnbase,MSnID,TargetDecoy
建议我	mzR,RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	mzID_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	mzID_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	mzID_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mzID
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ mzID
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/mzID/
包下载报告	下载数据