multiMiR

DOI:10.18129 / B9.bioc.multiMiR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅multiMiR。

集成多个microRNA-target数据库与他们的疾病和药物协会

Bioconductor版本:3.14

小分子核糖核酸/目标从外部资源的集合,包括验证microRNA-target数据库(miRecords, miRTarBase和TarBase),预测microRNA-target数据库(DIANA-microT、ElMMo缩影,米兰达,miRDB PicTar,皮塔饼和TargetScan)和microRNA-disease /药物数据库(miR2Disease, Pharmaco-miR诗句和PhenomiR)。

作者:Yuanbin俄文(aut),马特Mulvahill (cre, aut),斯宾塞Mahaffey (aut) (Katerina Kechris (aut cph,年代)

维护人员:马特Mulvahill <马特。在gmail.com mulvahill >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“multiMiR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“multiMiR”)

HTML	R脚本	multiMiR用户指南
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	Homo_sapiens_Data,Mus_musculus_Data,OrganismData,Rattus_norvegicus_Data,软件,miRNAData
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4)
进口	统计数据,XML,RCurl,purrr(> = 0.2.2),宠物猫(> = 1.2)、方法BiocGenerics,AnnotationDbi,dplyr
链接
建议	BiocStyle,刨边机,knitr,rmarkdown,testthat(> = 1.0.2中)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/KechrisLab/multiMiR
BugReports	https://github.com/KechrisLab/multiMiR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	multiMiR_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	multiMiR_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	multiMiR_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multiMiR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ multiMiR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/multiMiR/
包下载报告	下载数据