microbiomeDASim

DOI:10.18129 / B9.bioc.microbiomeDASim

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅microbiomeDASim。

丰富微生物微分模拟

Bioconductor版本:3.14

仿真工具箱微分微生物组数据用于纵向分析。指定的几个功能形式可能意味着趋势。观察从多元正态模型。这个包的目的是能够模拟数据,以便准确地比较不同纵向微分丰度的方法。

作者:贾斯汀·威廉姆斯,赫克托耳Corrada布拉沃,詹妮弗·汤姆,约瑟夫·纳撒尼尔·保尔森

维护人员:贾斯汀·威廉姆斯在ucla.edu < williazo >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“microbiomeDASim”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“microbiomeDASim”)

PDF	R脚本	microbiomeDASim
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	微生物组,软件,可视化
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.6.0)
进口	图形,ggplot2,质量,tmvtnorm,矩阵,mvtnorm,pbapply统计数据,phyloseq,metagenomeSeq,Biobase
链接
建议	testthat(> =魅惑,knitr,devtools
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/williazo/microbiomeDASim
BugReports	https://github.com/williazo/microbiomeDASim/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	microbiomeDASim_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	microbiomeDASim_1.8.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	microbiomeDASim_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/microbiomeDASim
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ microbiomeDASim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/microbiomeDASim/
包下载报告	下载数据