此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见miaViz.
Bioconductor版本:3.14
miaViz包实现了绘图功能,在微生物组分析上下文中使用treesummarizeexperiment和相关对象。其中包括绘制树,图表和微生物组系列数据。该方案是更广泛的miaverse框架的一部分。
作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]——托马斯·博尔曼[au],利奥·拉赫蒂[au]
维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道
引文(从R内,输入引用(“miaViz”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“miaViz”)
超文本标记语言 | R脚本 | miaViz |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 微生物组,软件,可视化 |
版本 | 1.2.1 " |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | artist -2.0 |文件许可证 |
取决于 | R (>= 4.0),SummarizedExperiment,TreeSummarizedExperiment,米娅(> = 0.99),ggplot2,ggraph(> = 2.0) |
进口 | 方法、统计数据S4Vectors,BiocGenerics,BiocParallel,DelayedArray,嘘,ggtree,ggnewscale,冬青,宠物猫,tidytree,tidygraph,rlang,purrr,tidyr,dplyr,猿,DirichletMultinomial |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle,testthat,拼接而成,microbiomeDataSets |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | miaViz_1.2.1.tar.gz |
Windows二进制 | miaViz_1.2.1.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | miaViz_1.2.1.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miaViz |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/miaViz |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/miaViz/ |
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