miRmine

DOI:10.18129 / B9.bioc.miRmine

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅miRmine

数据包miRmine数据库作为RangedSummarizedExperiment miRNA-seq数据集

Bioconductor版本:3.14

miRmine数据库是一个集不同公开的表达谱miRNA-seq数据集,Panwar et al (2017) miRmine:人类microrna的表达的一个数据库,准备用这个作为RangedSummarizedExperiment数据包。

作者:科维奇Randjelovic (aut (cre)

维护人员:科维奇Randjelovic <科维奇。在sbgenomics.com randjelovic >

从内部引用(R,回车引用(“miRmine”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“miRmine”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“miRmine”)

HTML R脚本 miRmine
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews ExpressionData,Homo_sapiens_Data,RNASeqData,SequencingData,软件
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证 GPL (> = 3)
取决于 R (> = 3.4),SummarizedExperiment
进口
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,DESeq2
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 miRmine_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 miRmine_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉) miRmine_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/miRmine
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ miRmine
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/miRmine/
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