此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见metapod.
Bioconductor版本:3.14
实现了在基因组尺度数据集的差异分析中组合p值的各种方法。功能可以组合同一分析中不同测试的p值(例如,ChIP-seq中的基因组窗口,RNA-seq中的外显子),或用于不同分析中的相应测试(例如,重复比较,不同处理条件的影响)。支持在适当的情况下处理日志转换的输入p值、缺失值和加权。
作者:Aaron Lun [aut, cre]
维护者:Aaron Lun
引文(从R内,输入引用(“metapod”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“metapod”)
超文本标记语言 | R脚本 | 荟萃分析策略 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DifferentialPeakCalling,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.13 (R-4.1)(1年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | |
进口 | Rcpp |
链接 | Rcpp |
建议 | testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown |
SystemRequirements | c++ 11 |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | csaw,mumosa,食物 |
建议我 | TSCAN |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | metapod_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | metapod_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | metapod_1.2.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metapod |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/metapod |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/metapod/ |
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