网格

DOI:10.18129 / B9.bioc.meshes

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅网格。

网浓缩和语义分析

Bioconductor版本:3.14

网格(医学主题词)是NLM受控词汇表用于手动为MEDLINE / PubMed指数的文章。网格计算被三个方法由Entrez基因相关ID, gendoo, gene2pubmed RBBH。这种联系是浓缩和语义分析的基础。网格支持富集分析(代表比例和基因集富集分析)的基因列表或完整的表达谱。语义网的比较方面提供定量计算基因和基因之间的相似性组的方法。Schlicker网格实现蕾斯尼克提出的五个方法,分别是江,林和王,支持超过70种。

作者:Guangchuang Yu (aut (cre) Erqiang胡(施)

维护人员:Guangchuang于< guangchuangyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“网格”)

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文档

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HTML	R脚本	网格
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,MultipleComparison,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0)
进口	AnnotationDbi,剂量,enrichplot,GOSemSim、方法、跑龙套AnnotationHub,MeSHDbi,yulab.utils
链接
建议	knitr,rmarkdown,prettydoc
SystemRequirements
增强了
URL	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/
BugReports	https://github.com/GuangchuangYu/meshes/issues
取决于我
进口我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	meshes_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	meshes_1.20.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	meshes_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/meshes
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/网格
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/meshes/
包下载报告	下载数据