等压线

DOI:10.18129 / B9.bioc.isobar

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅等压线。

标记msm蛋白质组学数据分析和定量的恒压的

Bioconductor版本:3.14

等压线提供方法预处理、标准化和报告生成的定量质谱的蛋白质组学数据分析与等压标签标记,如iTRAQ和TMT。功能模块集成和验证PTM-centric数据集(isobar-PTM)。更多信息在http://www.ms-isobar.org上。

作者:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >和Jacques Colinge , with contributions from Alexey Stukalov , Xavier Robin and Florent Gluck

维护人员:Florian P布雷<弗洛里安。bw gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“等压线”)

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文档

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browseVignettes(“等压线”)

PDF	R脚本	等压线为开发人员bob电竞体育官网
PDF	R脚本	等压线天车的量化的数据集
PDF	R脚本	等压线包iTRAQ和TMT蛋白质量化
PDF	R脚本	用例等压线包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	生物信息学,ImmunoOncology,MassSpectrometry,MultipleComparisons,蛋白质组学,质量控制,软件
版本	1.40.0
Bioconductor自	BioC 2.9 (r - 2.14)(10.5年)
许可证	LGPL-2
取决于	R (> = 2.10.0),Biobase、统计数据、方法
进口	分配,plyr,biomaRt,ggplot2
链接
建议	MSnbase,OrgMassSpecR,XML,RJSONIO,Hmisc,gplots,RColorBrewer,gridExtra,limma,引导,DBI,质量
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/fbreitwieser/isobar
BugReports	https://github.com/fbreitwieser/isobar/issues
取决于我
进口我
建议我	RforProteomics
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	isobar_1.40.0.tar.gz
Windows二进制	isobar_1.40.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	isobar_1.40.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/isobar
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/等压线
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/isobar/
包下载报告	下载数据