imageHTS

DOI:10.18129 / B9.bioc.imageHTS

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅imageHTS。

高通量分析microscopy-based屏幕

Bioconductor版本:3.14

imageHTS R包致力于高通量分析microscopy-based屏幕。包提供了一个模块化和可扩展的框架部分细胞,提取定量细胞特性,预测细胞类型和浏览屏幕数据通过web接口。设计运行在分布式环境中,imageHTS提供了一个标准化的访问远程数据和促进高通量microscopy-based数据集的传播。

作者:格雷戈勒加索尔,西安,迈克尔•布特罗斯·沃尔夫冈•休伯

维修工:约瑟夫·巴里<约瑟夫。巴里在embl.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“imageHTS”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“imageHTS”)

PDF	R脚本	高通量分析与imageHTS microscopy-based屏幕
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,ImmunoOncology,预处理,软件,可视化
版本	1.44.1
Bioconductor自	BioC 2.7 (r - 2.12)(11.5年)
许可证	lgpl - 2.1
取决于	R (> = 2.9.0),EBImage(> = 4.3.12),cellHTS2(> = 2.10.0)
进口	工具,Biobase,hwriter、方法、vsn,统计,跑龙套,e1071
链接
建议	BiocStyle,质量
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	imageHTS_1.44.1.tar.gz
Windows二进制	imageHTS_1.44.1.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	imageHTS_1.44.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/imageHTS
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ imageHTS
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/imageHTS/
包下载报告	下载数据