此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见idpr.
Bioconductor版本:3.14
“idpr”旨在整合r中内在无序蛋白(IDPs)的计算分析工具。该软件包用于识别感兴趣的序列的IDPs的已知特征,易于报告和动态结果。此外,这个包包含了与其他R包一起使用的基于idp的序列分析工具。
作者:William M. McFadden [cre, aut], Judith L. Yanowitz [aut, fnd], Michael Buszczak [ctb, fnd]
维护者:威廉M.麦克法登
引文(从R内,输入引用(“idpr”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“idpr”)
超文本标记语言 | R脚本 | 电荷和水力学 |
超文本标记语言 | R脚本 | 无序矩阵小插图 |
超文本标记语言 | R脚本 | idpr包概述小插图 |
超文本标记语言 | R脚本 | IUPred装饰图案 |
超文本标记语言 | R脚本 | 序列映射小插图 |
超文本标记语言 | R脚本 | 结构趋势 |
参考手册 |
biocViews | CellBiology,蛋白质组学,软件,StructuralPrediction |
版本 | 1.4.0 |
在Bioconductor | BioC 3.12 (R-4.0)(1.5年) |
许可证 | LGPL-3 |
取决于 | R (>= 4.0.0) |
进口 | ggplot2(> = 3.3.0),magrittr(> = 1.5),dplyr(> = 0.8.5),plyr(> = 1.8.6),jsonlite(> = 1.6.1),rlang(> = 0.4.6),Biostrings(>= 2.56.0),方法(>= 4.0.0) |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,msa,猿,testthat,seqinr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/wmm27/idpr/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | idpr_1.4.0.tar.gz |
Windows二进制 | idpr_1.4.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | idpr_1.4.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/idpr |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/idpr |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/idpr/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |