的热图

DOI:10.18129 / B9.bioc.heatmaps

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见的热图

功能基因组学和序列特征的灵活热图

Bioconductor版本:3.14

该包提供了跨基因组区间绘制全基因组数据热图的功能,例如峰值或跨启动子的ChIP-seq信号。还提供了许多用于研究序列特征的函数。

作者:Malcolm Perry

维护者:Malcolm Perry

引文(从R内,输入引用(“热图”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“热图”)

超文本标记语言 R脚本 装饰图案的标题
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews FunctionalGenomicsSequenceMatching软件可视化
版本 1.18.0
在Bioconductor BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.4)
进口 方法,grDevices,图形,统计,BiostringsGenomicRangesIRangesKernSmoothplotrix矩阵EBImageRColorBrewerBiocGenericsGenomeInfoDb
链接
建议 BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7knitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 heatmaps_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 heatmaps_1.18.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) heatmaps_1.18.0.tgz
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/heatmaps
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/heatmaps
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/heatmaps/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网