此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见的热图.
Bioconductor版本:3.14
该包提供了跨基因组区间绘制全基因组数据热图的功能,例如峰值或跨启动子的ChIP-seq信号。还提供了许多用于研究序列特征的函数。
作者:Malcolm Perry
维护者:Malcolm Perry
引文(从R内,输入引用(“热图”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“热图”)
超文本标记语言 | R脚本 | 装饰图案的标题 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | FunctionalGenomics,SequenceMatching,软件,可视化 |
版本 | 1.18.0 |
在Bioconductor | BioC 3.5 (R-3.4)(5年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | 方法,grDevices,图形,统计,Biostrings,GenomicRanges,IRanges,KernSmooth,plotrix,矩阵,EBImage,RColorBrewer,BiocGenerics,GenomeInfoDb |
链接 | |
建议 | BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7,knitr,rmarkdown,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | heatmaps_1.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | heatmaps_1.18.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | heatmaps_1.18.0.tgz |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/heatmaps |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/heatmaps |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/heatmaps/ |
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