gtrellis

DOI:10.18129 / B9.bioc.gtrellis

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅gtrellis。

基因组水平框架布局

Bioconductor版本:3.14

基因组水平格子图可视化基因数据受制于基因类别(如染色体)。对于每个基因组的类别,多个维度数据被表示为跟踪描述从不同的方面不同的特性。这个包提供高灵活性安排基因类别和添加自定义图形的阴谋。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“gtrellis”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“gtrellis”)

HTML	R脚本	使基因组水平格子图
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R(> = 3.1.2)、网格IRanges,GenomicRanges
进口	circlize(> = 0.4.8),GetoptLong、grDevices跑龙套
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr,RColorBrewer,减价,rmarkdown,ComplexHeatmap(> = 1.99.0),开罗,png,jpeg,tiff
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/gtrellis
取决于我
进口我	YAPSA
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	gtrellis_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	gtrellis_1.26.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	gtrellis_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gtrellis
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ gtrellis
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/gtrellis/
包下载报告	下载数据