DOI:10.18129 / B9.bioc.graph

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅

图:一个包来处理图形数据结构

Bioconductor版本:3.14

一个包,它实现了一些简单的图形处理能力。

作者:r .绅士,伊丽莎白·惠伦w·胡贝尔猎鹰

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(图)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(图)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(图)

PDF R脚本 图形对象的属性
PDF R脚本 clusterGraph和distGraph
PDF R脚本
PDF R脚本 图设计
PDF R脚本 graphBAM和多重图类
PDF 参考手册

细节

biocViews GraphAndNetwork,软件
版本 1.72.0
Bioconductor自 BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.13.11)
进口 统计数据、stats4跑龙套
链接
建议 SparseM(> = 0.36),XML,RBGL,RUnit,集群
SystemRequirements
增强了 Rgraphviz
URL
取决于我 apComplex,biocGraph,BioMVCClass,生命网络,BLMA,CellNOptR,限幅器,CNORfeeder,EnrichmentBrowser,flowMerge,,GOstats,GraphAT,GRridge,GSEABase,超图,keggorthology,maigesPack,MineICA,pathRender,Pigengene,pkgDepTools,PoTRA,ppiData,RbcBook1,RBGL,RBioinf,RCyjs,Rgraphviz,ROntoTools,SNAData,SRAdb,topGO,vtpnet,yeastExpData
进口我 高山,AnnotationHubData,BgeeDB,BiocCheck,biocGraph,BiocOncoTK,BiocPkgTools,biocViews,BioPlex,bnem,相机,类别,categoryCompare,chimeraviz,ChIPpeakAnno,CHRONOS,CytoML,DAPAR,dce,DEGraph,DEsubs,epiNEM,EventPointer,fgga,flowCL,flowClust,flowUtils,flowWorkspace,,GAPGOM,GeneNetworkBuilder,GOSim,GraphAT,石墨,hyperdraw,KEGGgraph,keggorthology,keggorthology,MIGSA,mirIntegrator,mnem,NCIgraph,NeighborNet,netresponse,OncoSimulR,ontoProc,openCyto,oposSOM,OrganismDbi,pathview,,PhenStat,pkgDepTools,ppiStats,pwOmics,qpgraph,RCy3,RGraph2js,RpsiXML,rsbml,Rtreemix,SplicingGraphs,拖缆,trackViewer,VariantFiltering
建议我 AnnotationDbi,DEGraph,EBcoexpress,ecolitk,GeneAnswers,gwascat,KEGGlincs,中长期规划,NetPathMiner,rBiopaxParser,rTRM,S4Vectors,SPIA,VariantTools
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 graph_1.72.0.tar.gz
Windows二进制 graph_1.72.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) graph_1.72.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/graph
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/图
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/graph/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网