这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ggspavis。
Bioconductor版本:3.14
可视化功能空间解决转录组数据集存储在SpatialExperiment格式。包括函数来创建多种类型的情节从spot数据基于(例如10 x基因组Visium)和分子(如seqFISH)技术平台。
作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)海伦娜l . Crowell (aut)
维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >
从内部引用(R,回车引用(“ggspavis”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggspavis”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ggspavis”)
HTML | R脚本 | ggspavis概述 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | SingleCell,软件,转录组 |
版本 | 1.0.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | ggplot2 |
进口 | SpatialExperiment,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,ggside、网格方法,统计数据 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,rmarkdown,knitr,STexampleData,BumpyMatrix,嘘,食物,uwot,testthat(> = 3.0.0) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/lmweber/ggspavis |
BugReports | https://github.com/lmweber/ggspavis/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ggspavis_1.0.0.tar.gz |
Windows二进制 | ggspavis_1.0.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | ggspavis_1.0.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggspavis |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggspavis |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ggspavis/ |
包下载报告 | 下载数据 |