ggspavis

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggspavis

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ggspavis

可视化功能空间解决转录组数据

Bioconductor版本:3.14

可视化功能空间解决转录组数据集存储在SpatialExperiment格式。包括函数来创建多种类型的情节从spot数据基于(例如10 x基因组Visium)和分子(如seqFISH)技术平台。

作者:卢卡斯·m·韦伯(aut (cre)海伦娜l . Crowell (aut)

维护人员:卢卡斯·m·韦伯在gmail.com < lukas.weber.edu >

从内部引用(R,回车引用(“ggspavis”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggspavis”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ggspavis”)

HTML R脚本 ggspavis概述
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews SingleCell,软件,转录组
版本 1.0.0
Bioconductor自 BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 ggplot2
进口 SpatialExperiment,SingleCellExperiment,SummarizedExperiment,ggside、网格方法,统计数据
链接
建议 BiocStyle,rmarkdown,knitr,STexampleData,BumpyMatrix,,食物,uwot,testthat(> = 3.0.0)
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/lmweber/ggspavis
BugReports https://github.com/lmweber/ggspavis/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ggspavis_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 ggspavis_1.0.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) ggspavis_1.0.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggspavis
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggspavis
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ggspavis/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网