ggcyto

DOI:10.18129 / B9.bioc.ggcyto

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ggcyto

可视化与ggplot血细胞计数数据

Bioconductor版本:3.14

专用增强方法实现flowSet, ncdfFlowSet和GatingSet类,生和封闭的流式细胞仪数据可以直接与ggplot绘制。ggcyto包装和一些习惯了层还可以很容易地添加盖茨和人口统计的阴谋。

作者:迈克江

维修工:迈克江泽民< wjiang2 fhcrc.org >,杰克瓦格纳< jpwagner fhcrc.org >

从内部引用(R,回车引用(“ggcyto”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ggcyto”)

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文档

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HTML R脚本 特性的总结ggcyto
HTML R脚本 血细胞计数数据的快速绘制
HTML R脚本 可视化与ggcyto flowSet
HTML R脚本 可视化与ggcyto GatingSet
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CellBasedAssays,FlowCytometry,ImmunoOncology,基础设施,软件,可视化
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 方法,ggplot2(> = 3.3.0),flowCore(> = 1.41.5),ncdfFlow(> = 2.17.1),flowWorkspace(> = 3.33.1)
进口 plyr,尺度,hexbin,data.table,RColorBrewer,gridExtra,rlang
链接
建议 testthat,flowWorkspaceData,knitr,rmarkdown,flowStats,openCyto,flowViz,ggridges,vdiffr
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RGLab/ggcyto/issues
取决于我
进口我 CytoML
建议我 催化剂,flowCore,flowStats,flowTime,flowWorkspace,openCyto
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ggcyto_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 ggcyto_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ggcyto_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ggcyto
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ggcyto
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ggcyto/
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