genphen

DOI:10.18129 / B9.bioc.genphen

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅genphen。

genphen:工具量化genotype-phenotype协会的全基因组关联研究(GWAS)

Bioconductor版本:3.14

基因关联研究帮助我们发现基因型和表型之间的关系。genphen genotype-phenotype协会是一个量化的计算工具使用混合方法基于统计学习技术和概率模型,贝叶斯推理进行了分析计算。

作者:单Kitanovski (aut (cre)

维护人员:单Kitanovski <极点。在uni-due.de kitanovski >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“genphen”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“genphen”)

PDF	R脚本	genphen概述
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	贝叶斯,分类,FeatureExtraction,遗传学,GenomeWideAssociation,回归,SequenceMatching,测序,软件,SupportVectorMachine
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.5.0),Rcpp(> = 0.12.17)方法、统计图形
进口	rstan(> = 2.17.3),管理员平行,foreach,doParallel,e1071,Biostrings,rPref
链接
建议	testthat,ggplot2,gridExtra,猿,ggrepel,knitr,重塑,xtable
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/snaketron/genphen/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	genphen_1.22.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	genphen_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genphen
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ genphen
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/genphen/
包下载报告	下载数据